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Craif、尿中マイクロRNAと代謝物を組み合わせたバイオAI解析による多がん種早期検出(MCED)の研究成果を第85回日本癌学会学術総会にて発表

研究
2026.10.23

 バイオAIスタートアップのCraif株式会社(所在地:東京都新宿区、代表取締役CEO:小野瀨隆一、以下「Craif」)は、2026年9月24日(木)〜26日(土)に国立京都国際会館にて開催された「第85回日本癌学会学術総会」において、国内7医療機関との共同研究成果「尿中マイクロRNA・small RNA・N1,N12-ジアセチルスペルミンのマルチモーダル解析による多がん早期検出」を発表いたしました。本研究では、尿中のマイクロRNA(miRNA)・small RNA・N1,N12-ジアセチルスペルミン(DiAcSpm)を統合的に解析することで、単一の尿検査により複数のがん種を高精度に検出できる可能性を示しました。

■ 研究成果のポイント

  • miRNAに加え、tRF・piRNAやN1,N12-ジアセチルスペルミン(DiAcSpm)を統合することで進行期(Stage III/IV)の検出精度が向上: 膵臓・肺・胃・食道・大腸・腎臓・尿路上皮・乳房・卵巣・前立腺の10がん種を対象とした統合検出モデルで、small RNAモデルに尿中DiAcSpm値を統合すると、全体のはAUCは0.02、進行期(Stage III/IV)に限るとAUCは0.05向上しました。DiAcSpmはがん種非特異的に10がん種全てで上昇がみられ、DiAcSpmの検出力が上がる進行期でsmall RNAと相補的に働くことにより、統合モデルとしての検出精度向上に寄与することが示されました。
  • 予後不良5がん種に絞るとAUCはさらに上昇: 5年生存率70%以下の5がん種(膵臓・肺・食道・尿路上皮・卵巣)に対象を絞ると、進行期(Stage III/IV)のAUC はさらに0.04向上しました。
  • がん種特異的なsmall RNAシグナルを確認、原発巣推定への応用に期待: 各がん種につきRNAクラスごとに最も差次発現するsmall RNA分子を選定した計36特徴量において、がん種ごとに特異的に発現するsmall RNA分子が観測されました。将来的に陽性判定後にがんの原発巣(Tissue of Origin)を推定する応用につながる可能性があります。

■ 研究概要

 日本では年間約100万人ががんと診断され、約38.4万人ががんで亡くなっています。(※1)現行のがん検診がカバーするのは5がん種(診断数の約50%)にとどまり、膵臓がんなど致死性の高いがん種は検診の対象外です。また、受診率は政策目標である60%にも届いていないのが現状です。

本研究では、がん患者1,120名・非がん対照268名(計1,388名、10がん種)から尿検体を収集し、多がん種早期検出(MCED)モデルの開発を行いました。細胞外小胞(EV)濃縮後にSmall RNA-seq(miRNA+tRF/tRNA/piRNA)およびDiAcSpmのELISA測定を実施しました。多重カーネルSVMモデルにより、モダリティごとの特徴(RNAにはRBFカーネル、DiAcSpmには線形カーネル)を捉えつつ最適に重み付け統合し、ネステッド交差検証によるout-of-foldスコアで頑健に性能を評価しました。

その結果、small RNAとDiAcSpmの統合モデルでAUCが向上するとともに、がん種ごとに固有かつ相互に独立したsmall RNAシグナルが確認され、原発巣推定への応用可能性が示唆されました。

※1.国立がん研究センター『がんの統計2026』
■ 共同研究機関一覧(順不同)

  • 医療法人社団慈昂会 白石内科クリニック
  • 医療法人北武会 美しが丘病院
  • 公益財団法人仙台市医療センター 仙台オープン病院
  • 国立大学法人東海国立大学機構 岐阜大学医学部附属病院
  • 弘前大学医学部附属病院
  • 社会医療法人北海道恵愛会 札幌南三条病院
  • 三重大学医学部附属病院

■ 第85回日本癌学会学術総会について

  • 名称:第85回日本癌学会学術総会(The 85th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association)
  • 開催期間:2026年9月24日(木)〜26日(土)
  • 開催地:国立京都国際会館(京都府京都市)
  • 公式ホームページ:https://www.c-linkage.co.jp/jca2026

■ 用語説明

  • piRNA (PIWI-interacting RNA):長さ24~30塩基程度の小さなRNAで、主に細胞の中で遺伝情報を守る働きをしており、不要な遺伝子の活動やウイルス由来の配列を抑える役割があります。近年では、がんの発生や進行との関連も注目されており、特定のpiRNAの量ががんの種類や状態を反映する可能性が報告されています。
  • tRF (tRNA-derived Fragment):タンパク質合成に関わるtransfer RNAが分解されてできる長さ15~50塩基程度の小さなRNAです。細胞増殖やストレス応答、がんの進行などに関与することがわかってきています。特定のtRFの増減は、がん細胞の状態や病気の特徴を示す指標となる可能性があると報告されています。
  • small RNA:短いRNA分子の総称で、代表的なものにマイクロRNA、piRNA、tRFなどが含まれます。これらは遺伝子の働きを調節する役割を持ち、細胞の増殖、分化、免疫応答などさまざまな生命現象に関与しています。がんを含む多くの病気でsmall RNAの発現パターンが変化することから、診断や治療効果予測のバイオマーカーとして研究されています。

■ Craifについて

 Craif(クライフ)は がん早期発見に取り組む2018年創業のバイオAIスタートアップです。尿をはじめとする体液から、DNAやマイクロRNAなど多様なバイオマーカーを高精度に検出する独自の解析技術基盤「NANO IP®︎(NANO Intelligence Platform)」とAI技術を融合し、がんの超早期発見・早期治療・早期復帰を可能にする革新的な検査を開発しています。バイオテクノロジーとAIの力を社会に広く届けることで、当社のビジョンである「人々が天寿を全うする社会の実現」を推進します。

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